18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2961 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1862  hypothetical protein  99.69 
 
 		 321 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.378976  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2961  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2569  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.626999  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1141  hypothetical protein  24.42 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  hitchhiker  0.0000472475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  24.88 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  24.69 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  24.88 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  24.69 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  24.69 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  20.94 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  24.69 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  24.69 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  24.69 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  24.69 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  29.1 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>