32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1450 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1450  acyltransferase 3  100 
 
 
392 aa  757    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012691  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1615  acyltransferase 3  33.5 
 
 
405 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2451  acyltransferase 3  33 
 
 
395 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1319  hypothetical protein  32.74 
 
 
438 aa  156  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0865  acyltransferase 3  33.7 
 
 
442 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0774  hypothetical protein  30.48 
 
 
468 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1444  acyltransferase 3  34.63 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0727  hypothetical protein  29.79 
 
 
398 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1149  acyltransferase  26.87 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1364  acyltransferase  25.39 
 
 
386 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.510476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1010  acyltransferase 3  26.73 
 
 
401 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.114811  hitchhiker  0.00000776761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  26.4 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0863  acyltransferase  26.42 
 
 
166 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.340911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2296  intercellular adhesion protein C  20.93 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  22.26 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  30.41 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1856  acyltransferase 3  26.84 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  22.85 
 
 
387 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1039  acyltransferase 3  31.94 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0220437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5338  hypothetical protein  22.87 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5621  hypothetical protein  22.96 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000213168 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  24.36 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  23.04 
 
 
334 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  25.12 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  27.59 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  24.55 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  23.99 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  23.48 
 
 
675 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.03 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2750  intercellular adhesion protein C, putative  19.93 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2693  polysaccharide intercellular adhesin (PIA) synthesis/biofilm formation-like protein  19.93 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  30.61 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>