25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1039 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1039  acyltransferase 3  100 
 
 
377 aa  722    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0220437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2246  hypothetical protein  35.54 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal  0.322709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  30.66 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1450  acyltransferase 3  35.5 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012691  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  32.09 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1010  acyltransferase 3  25.98 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.114811  hitchhiker  0.00000776761 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1149  acyltransferase  28.29 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1319  hypothetical protein  26.2 
 
 
438 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1856  acyltransferase 3  29.29 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0727  hypothetical protein  24.85 
 
 
398 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1364  acyltransferase  29.31 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.510476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2451  acyltransferase 3  23.56 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0792  hypothetical protein  21.97 
 
 
359 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298441  normal  0.0360506 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0863  acyltransferase  24.83 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.340911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1615  acyltransferase 3  27.63 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  29.14 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1444  acyltransferase 3  23.78 
 
 
460 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  26.16 
 
 
337 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2177  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  25.97 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  25.27 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  26.73 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  28.06 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>