28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06310  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  754    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  28.33 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  28 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  27.67 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  27.67 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  25.29 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  26.67 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  26.89 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  25 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  23.58 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  25.59 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  27.51 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  25.16 
 
 
337 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  28.48 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  24.84 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  23.46 
 
 
337 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  27.67 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  27.5 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  33.33 
 
 
352 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  31.16 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2474  hypothetical protein  25.6 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  25.96 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  25.42 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  27.44 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  22.32 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  22.66 
 
 
387 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  22.37 
 
 
351 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1184  hypothetical protein  23.08 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>