16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1180 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1180  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0744588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1052  putative succinyltransferase involved in succinoglycan biosynthesis  43.86 
 
 		 195 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1054  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.938326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4954  succinyltransferase protein  23.39 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.144188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18250  hypothetical protein  23.68 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3043  hypothetical protein  24.4 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3799  hypothetical protein  20.88 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.937718  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5930  succinoglycan biosynthesis protein  23.12 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  26.38 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  26.38 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  26.38 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06990  hypothetical protein  41.43 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  31.78 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>