34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0352 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  100 
 
 
399 aa  783    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  28.43 
 
 
405 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  35.08 
 
 
395 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  30.1 
 
 
390 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  27.95 
 
 
419 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  31.25 
 
 
397 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  28.11 
 
 
376 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  26.54 
 
 
412 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  30.54 
 
 
407 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  27.55 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  29.14 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  29.66 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  27.46 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  28.09 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  28.78 
 
 
402 aa  86.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  29.9 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  25.84 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  26.55 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  26.18 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  24.87 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  34.07 
 
 
349 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  27.27 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  26.59 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.44 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  24.71 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  24.14 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  24.14 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  24.14 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  24.14 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  23.21 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  24.14 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  23.21 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  27.82 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  31.18 
 
 
355 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>