28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3660 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  89.71 
 
 
407 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  100 
 
 
408 aa  775    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  95.59 
 
 
407 aa  674    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  30.02 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  31.47 
 
 
397 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  29.15 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  28.27 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  32.58 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  29.46 
 
 
376 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  21.45 
 
 
412 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  27.92 
 
 
411 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  23.63 
 
 
400 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  30.64 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  29.32 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  31.71 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  27.12 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  29.38 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  29.33 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  24.04 
 
 
369 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  25.15 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  33.64 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  26.23 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  26.45 
 
 
405 aa  47  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  26.32 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  30.77 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  27.15 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  26.63 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  27.67 
 
 
394 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>