19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1821 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  774    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  44.33 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  33.66 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  34.07 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  31.67 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  33.57 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  32.66 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  34.9 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  29.07 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  33.25 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  27.2 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  31.61 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  24.75 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  30.31 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  30.23 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  26.38 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  33.78 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  23.54 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>