20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3423 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  100 
 
 		 400 aa  811    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  33.66 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  32.32 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  32.74 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  27.59 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  30 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  28.35 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  28.68 
 
 		 390 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  28.92 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  27.34 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  24.69 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  23.63 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  22.83 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  23.34 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  28.5 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  24.71 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  27.85 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  20.71 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>