18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01350 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  25.41 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  23.5 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  25.68 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  26.67 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  26.15 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  26.94 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  24.65 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  24.44 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  23.3 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  28.37 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  25.15 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  33.33 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  21.05 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  19.24 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  23.93 
 
 		 413 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>