24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3623 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  100 
 
 		 413 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  44.33 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  33.94 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  33.59 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  33.25 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  29 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  31.19 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  27.5 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  30.9 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  31.58 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  26.46 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  24.75 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  27.18 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  26.78 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  27.25 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  26.95 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  22.61 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  28.93 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  28.24 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  25.59 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  25.81 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  31.52 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  25 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>