55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3626 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  100 
 
 		 405 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  33.76 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  35.55 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  33.16 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  31.44 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  29.68 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  30.07 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  27.76 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  29.75 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  30.02 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  28.35 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  29.85 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  27.91 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  28.93 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  26.84 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  23.66 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  29.81 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  23.98 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  23.34 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  23.35 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  23.08 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  23.4 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  23.17 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  22.39 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  23.17 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  23.17 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  23.17 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  23.08 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  22.68 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  23.08 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  23 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  23.17 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  23.17 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  23.17 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  26.3 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  22.39 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  22.42 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  38.78 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  28.66 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  33.64 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  22.51 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  25.73 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0845  hypothetical protein  22.49 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  21.62 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  29.94 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  23.89 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  30.52 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  25.33 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  26.16 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  26.16 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  30.29 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  28.93 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  25.58 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>