38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2486 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  823    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  33.92 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  33.08 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  36.21 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  31 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  32.9 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  29.7 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  30.77 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  26.68 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  27.11 
 
 		 364 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  26.49 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  26.4 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  24.37 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  25.37 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  27.38 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  27.11 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  25.99 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  24.81 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.91 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  30.81 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  24.19 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  22.42 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  25.25 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  24.04 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  24.73 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  26 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  23.53 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  24.8 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  30 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  21.05 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  21.48 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  22.58 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>