43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5571 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  100 
 
 
389 aa  759    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  48.7 
 
 
396 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  32.83 
 
 
410 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  35.64 
 
 
376 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  34.03 
 
 
387 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  31.76 
 
 
399 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  30.94 
 
 
413 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  31.99 
 
 
386 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  31.99 
 
 
386 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  31.58 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  31.02 
 
 
385 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  27.04 
 
 
397 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  30.17 
 
 
364 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  28.5 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  27.38 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  25.7 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  33.69 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  29 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  28.03 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  35.03 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.37 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  26.21 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  29.93 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  26.51 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  36.21 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  22.92 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  22.34 
 
 
408 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  34.02 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  24.94 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0845  hypothetical protein  23.62 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  34.29 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  22.68 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  24.84 
 
 
376 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  22.92 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  33.94 
 
 
351 aa  46.2  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  23.82 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  23.24 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  28.66 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  23.82 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  23.53 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  23.24 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  33.87 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  23.96 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>