34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1787 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  100 
 
 		 393 aa  784    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  76.52 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  72.59 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  65.17 
 
 		 393 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  55.98 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  57.68 
 
 		 398 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  31.73 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  32.65 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  30.05 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  26.36 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  24.37 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  31.9 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  31.9 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  31.9 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  28.4 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  30.99 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  27.25 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  26.39 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  31.76 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  25.53 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  24.79 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  31.65 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  28.19 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  34.58 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  29.94 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  24.31 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  24.86 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  28.57 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  25.54 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  25.86 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>