35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2068 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  100 
 
 		 396 aa  764    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  48.44 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  31.05 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  36.27 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  32.48 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  30.54 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  32.52 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  32.38 
 
 		 385 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  32.48 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  32.49 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  32.49 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  28.85 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  32.93 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  24.57 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  38.46 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  23.47 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  29.79 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.14 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  23.43 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  24.36 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  27.82 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  24.88 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  32.23 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  23.14 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  23.95 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  23.79 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  28.99 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  30.29 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  27.49 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0845  hypothetical protein  22.99 
 
 		 358 aa  49.7  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  34.59 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  22.37 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  22.82 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  28.64 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  32.14 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>