39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6143 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  95.58 
 
 
385 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  51.06 
 
 
387 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  40.52 
 
 
385 aa  245  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  32.81 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  29.19 
 
 
410 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  28.18 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  31.79 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  27.39 
 
 
399 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  24.34 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  25.43 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.9 
 
 
550 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  32.02 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  31.28 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  24.81 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  31.36 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  31.9 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  25.51 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  29.2 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  26 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  29.19 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  21.36 
 
 
408 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  25 
 
 
405 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  22.62 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  35.16 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  21.1 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  26.03 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  34.12 
 
 
473 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  22.72 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  26.16 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  31.79 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  24.18 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  36.07 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  29.94 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  29.94 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  31.29 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  31.29 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  31.29 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>