28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2447 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  50.51 
 
 
394 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.55 
 
 
403 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  32.83 
 
 
394 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  31.33 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  31.73 
 
 
393 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  28.22 
 
 
394 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  30.36 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  29.7 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  28.96 
 
 
390 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  26.49 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  25.76 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  27.82 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  24.3 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  24.57 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  31.36 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  31.36 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  31.36 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  27.43 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  25.64 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  24.88 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  26.58 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  23.24 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  28.57 
 
 
356 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  26.32 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  29.82 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  34.29 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  41.67 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>