30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2980 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  39.44 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  36.46 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  37.4 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  39.02 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  36.34 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  37.4 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.57 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  31.22 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  28.96 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  27.63 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  24.75 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  27.23 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  24.62 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  30.25 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  30.25 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  31.18 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  30.86 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  25 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  31.37 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  23.76 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  27.88 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  22.14 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  24.16 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  25.86 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  31.37 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  32.26 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.52 
 
 		 550 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>