44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0262 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  82.81 
 
 		 413 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  100 
 
 		 399 aa  787    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  43.15 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  33.92 
 
 		 410 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  33.17 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  30.9 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  27.03 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  28.85 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  31.47 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  26.48 
 
 		 385 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  28.05 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  27.14 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  27.14 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  27.32 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  25.94 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  28.74 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  25.83 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  28.5 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  26.46 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  25.06 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  24.32 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  26.12 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  24.88 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  28.9 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  25.53 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  25.77 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  30.12 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  27.78 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  21.12 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  27.5 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  27.85 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  27.32 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  23.37 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  31.37 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  23.7 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  26.5 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  24.84 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  22.98 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  28.66 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  24.66 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>