29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4114 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  100 
 
 
397 aa  816    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  41.8 
 
 
395 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  34.44 
 
 
419 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  33.42 
 
 
405 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  32.59 
 
 
390 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  34.63 
 
 
411 aa  196  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  34.2 
 
 
413 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  34.24 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  28.72 
 
 
412 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  30 
 
 
400 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  31.32 
 
 
384 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  30.46 
 
 
407 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  29.32 
 
 
376 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  30.28 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  31.47 
 
 
408 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  31.52 
 
 
399 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  29.56 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  23.13 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  23.08 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  27.27 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  21.74 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  22.03 
 
 
421 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.12 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  23.91 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  22.28 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  28.92 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  26.77 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  25.16 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  21.11 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>