32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1853 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  754    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  35.49 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  28.19 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  31.94 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  30.91 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  31.99 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  28.93 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  31.33 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  33.42 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  27.34 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  28.03 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  24.43 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  28.39 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  25.81 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  29.3 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  24.32 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  29.06 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.78 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  28.31 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  23.86 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  24.49 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  24.55 
 
 		 399 aa  46.2  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  22.51 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  22.51 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  23.06 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  22.51 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>