31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2284 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  99.48 
 
 		 385 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  99.48 
 
 		 385 aa  776    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  99.48 
 
 		 385 aa  776    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  82.2 
 
 		 384 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  81.94 
 
 		 384 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  82.72 
 
 		 384 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  82.2 
 
 		 384 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  82.59 
 
 		 384 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  100 
 
 		 385 aa  780    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  99.48 
 
 		 385 aa  776    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  99.74 
 
 		 385 aa  778    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  99.48 
 
 		 385 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  99.74 
 
 		 385 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  99.48 
 
 		 385 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  79.37 
 
 		 385 aa  618  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  58.13 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1660  osmoregulated periplasmic glucan biosynthetic protein  41.27 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  24.25 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.81 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  23.17 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  23.14 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  26.42 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  24.05 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  23.68 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  26.17 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  22.51 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  26.88 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  23.73 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  29.61 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6950  glucans biosynthesis protein  25.23 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.91383  normal  0.275978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>