69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0754 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  64.19 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  33.33 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  33.09 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  28 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.73 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.8 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.94 
 
 		 210 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  27.91 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  29.73 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.92 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  27.2 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  36.08 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  29.61 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  32.54 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  29.22 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.14 
 
 		 550 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.3 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  32.08 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  34.91 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  24.66 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  26.67 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  24.66 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.07 
 
 		 274 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  25.34 
 
 		 269 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  27.83 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  23.68 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  28.7 
 
 		 243 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  34.59 
 
 		 262 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 270 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  28.81 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.61 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.32 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.48 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  27.4 
 
 		 267 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.58 
 
 		 274 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  25.55 
 
 		 249 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  26.85 
 
 		 252 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  27.18 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.29 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  25.55 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  25.93 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  25.55 
 
 		 298 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 264 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  30 
 
 		 286 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 277 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  26.61 
 
 		 242 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  26.21 
 
 		 260 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  23.4 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  23.08 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  22.76 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 276 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1123  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.65 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  23.14 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  22.73 
 
 		 236 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  29.09 
 
 		 132 aa  40.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  24.27 
 
 		 242 aa  40.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>