32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3920 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 161 aa  328  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  32.54 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  31.97 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  29.84 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  29.66 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  31.06 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  29.84 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.5 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.58 
 
 		 550 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  22.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.69 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  26.98 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 301 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.11 
 
 		 274 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  23.62 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  28.24 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  27.27 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 277 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  30.26 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  28.26 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  38.36 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 286 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  22.79 
 
 		 298 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  29.21 
 
 		 155 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  21.48 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  22.79 
 
 		 257 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  36.59 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.81 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 264 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>