50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07010 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  700    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  33.14 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  31.84 
 
 		 175 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  29.83 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  21.02 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  21.57 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  30.92 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  31.01 
 
 		 175 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  33.75 
 
 		 155 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  33.62 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  29.24 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  29.68 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  29.22 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  29.56 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  24.73 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3907  hypothetical protein  21.47 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  22.78 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  39.77 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  27.01 
 
 		 177 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  25.29 
 
 		 179 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.11 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  24.86 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  27.67 
 
 		 165 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  25.34 
 
 		 176 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  27.17 
 
 		 179 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  24.36 
 
 		 164 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  22.78 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  26.88 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  26.88 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  25.71 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.89 
 
 		 550 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  27.97 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  26.25 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  24.29 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  27.48 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.98 
 
 		 160 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  29.2 
 
 		 132 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  20 
 
 		 191 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  21.29 
 
 		 167 aa  42.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  25.26 
 
 		 156 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>