30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0056 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  46.63 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  46.63 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  49.7 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  47.19 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  47.46 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  48.15 
 
 		 178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  46.67 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  41.53 
 
 		 347 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  44.17 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  39.66 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  30.46 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  31.67 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  28.98 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  28.74 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  27.78 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  30.17 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  31.58 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  28.39 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  30.26 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  28.08 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  24.86 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  29.49 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  29.14 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  30.57 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  30.41 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  24.26 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  25.49 
 
 		 309 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  25.49 
 
 		 309 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  23.42 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>