30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0816 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  55.11 
 
 		 177 aa  217  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  53.98 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  53.37 
 
 		 209 aa  215  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  57.87 
 
 		 184 aa  204  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  52.38 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  47.46 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  45.2 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  45.2 
 
 		 347 aa  171  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  45.51 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  35.93 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  31.28 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  31.46 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  33.15 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  32.22 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  28.95 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  34.23 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  28.09 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  30.26 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  26.14 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  26.14 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  27.81 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  30.94 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  26 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  26.32 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  26.52 
 
 		 343 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  23.68 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  19.63 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  21.19 
 
 		 309 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>