27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3791 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  48.19 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 		 347 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  39.55 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  40.68 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  37.13 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  40.68 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  39.2 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  36.02 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  30.46 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  25.3 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  25.57 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  27.92 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  28.42 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  24.82 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  27.67 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  22.03 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  23.65 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  22.52 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  26.97 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  25.97 
 
 		 393 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>