26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3790 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  47.22 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  46.07 
 
 
177 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  45.45 
 
 
209 aa  154  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  42.22 
 
 
179 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
347 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  44.58 
 
 
180 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  40.68 
 
 
177 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  39.2 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  41.01 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  39.66 
 
 
184 aa  127  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  38.51 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  31.91 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  30.73 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  33.66 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  27.12 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  26.97 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  30.3 
 
 
309 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  27.1 
 
 
309 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  28.21 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  27.1 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  25.97 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  28.7 
 
 
393 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  27.21 
 
 
223 aa  44.7  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  23.2 
 
 
393 aa  44.3  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>