40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  45.95 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  45.7 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  46.67 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  44.3 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  47.06 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  46.62 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  39.74 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  44.3 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  37.33 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  31.33 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  31.33 
 
 		 309 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  35.37 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  28.39 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  35.46 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  35.46 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  35.46 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  35.46 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  35.46 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  30.92 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  34.75 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  34.75 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  29.41 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  31.21 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  32.89 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  28.48 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  29.11 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  30.41 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  27.45 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  28.29 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  30.94 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  29.22 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  25.17 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  27.92 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  26.76 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  23.78 
 
 		 357 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>