42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4243 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  347  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  32.74 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  38.86 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  35.5 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  39.87 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  30.59 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  31.43 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  33.15 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  35.37 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  35.47 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  34.69 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  27.68 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  37.33 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  27.91 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  34.48 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  34.64 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  29.11 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  25.64 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  23.76 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0682  hypothetical protein  24.55 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0600  hypothetical protein  23.95 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  22.29 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  24.28 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  23.21 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  24.29 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  30.5 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  30.5 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  24.65 
 
 		 309 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  23.21 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3627  Polyketide cyclase/dehydrase  30.07 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2882  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.48 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  20 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  25.58 
 
 		 393 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  25.54 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.07 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  20.2 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>