44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001595 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  68.93 
 
 		 309 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  28.76 
 
 		 155 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  31.17 
 
 		 165 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  31.33 
 
 		 154 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  28.86 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  21.64 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  26.97 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  28.19 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  22.06 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  25.68 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  32.03 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  27.81 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  27.5 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  26 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  25.16 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  30.92 
 
 		 177 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  28 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  27.63 
 
 		 180 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  28 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  25.49 
 
 		 184 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  28.89 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  24.65 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  22.26 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  25.83 
 
 		 242 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  23.65 
 
 		 174 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.15 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  25.83 
 
 		 242 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  24 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3907  hypothetical protein  20.37 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  30.71 
 
 		 156 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  25.21 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  26.72 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  22.14 
 
 		 157 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  25.22 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  21.66 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  25.95 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3069  hypothetical protein  22.06 
 
 		 152 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  24.16 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  21.19 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>