30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0761 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  65.34 
 
 
177 aa  254  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  59.09 
 
 
177 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  58.99 
 
 
209 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  56.74 
 
 
179 aa  224  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  53.99 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  50.56 
 
 
179 aa  197  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  52.25 
 
 
184 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  52.27 
 
 
347 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  48.33 
 
 
184 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  44.38 
 
 
176 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  38.15 
 
 
174 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  35.75 
 
 
177 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  31.46 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  28.41 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  29.41 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  27.78 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  25.15 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  25.88 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  28.1 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  27.92 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  28.29 
 
 
154 aa  61.2  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  26.32 
 
 
309 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  27.63 
 
 
309 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  23.73 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  23.18 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  20.25 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  23.53 
 
 
393 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>