41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0648 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  68.18 
 
 		 177 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  58.52 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  59.52 
 
 		 180 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  59.66 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  55.83 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  51.34 
 
 		 184 aa  201  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  50.85 
 
 		 347 aa  191  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  46.63 
 
 		 184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  45.45 
 
 		 176 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  128  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  34.09 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  33.9 
 
 		 177 aa  95.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  31.46 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  28.18 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  29.61 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  30.82 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  31.37 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  30.51 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  32.45 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  27.92 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  28.57 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  25.17 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  24.39 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0682  hypothetical protein  22.28 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  23.39 
 
 		 343 aa  48.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0600  hypothetical protein  21.74 
 
 		 395 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  21.62 
 
 		 393 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>