30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4774 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  794    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  31.33 
 
 
343 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  22.06 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  21.64 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  30.26 
 
 
175 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  23.7 
 
 
175 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  26.32 
 
 
176 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  29.53 
 
 
179 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  30.92 
 
 
223 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  27.7 
 
 
179 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  25.36 
 
 
182 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  25.14 
 
 
209 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  29.73 
 
 
155 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  23.97 
 
 
153 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  27.59 
 
 
171 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  26.14 
 
 
177 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  23.37 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  27.84 
 
 
180 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  26.42 
 
 
177 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  26.17 
 
 
165 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  25.83 
 
 
179 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  23.53 
 
 
274 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  27.61 
 
 
176 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.66 
 
 
274 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.77 
 
 
164 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  25.34 
 
 
177 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  23.53 
 
 
180 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>