34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05573 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  68.93 
 
 
309 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  31.33 
 
 
154 aa  86.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  31.17 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  21.02 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  28.19 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  28.19 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  27.63 
 
 
153 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  27.92 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  21.64 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  28.19 
 
 
179 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  27.33 
 
 
176 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  28.48 
 
 
179 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  28.67 
 
 
176 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  29.41 
 
 
179 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  26.32 
 
 
180 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  29.14 
 
 
177 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  24.68 
 
 
223 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  23.49 
 
 
177 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  27.55 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  26 
 
 
177 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  25.49 
 
 
184 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  26.67 
 
 
179 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  26.97 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  37.8 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.1 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  23.68 
 
 
178 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  22.67 
 
 
182 aa  46.2  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3907  hypothetical protein  23.84 
 
 
343 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>