38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3167 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  57.06 
 
 		 177 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  51.34 
 
 		 209 aa  209  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  56.36 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  52.54 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  51.79 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  50.85 
 
 		 347 aa  185  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  48.02 
 
 		 179 aa  184  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  45.76 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  41.01 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  37.72 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  33.9 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  36.16 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  32.42 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  32.58 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  31.21 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  28.48 
 
 		 223 aa  72  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  27.45 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  25.99 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  27.68 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  30.26 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  25.49 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  27.15 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  30.26 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  28 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  26.01 
 
 		 343 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  26.97 
 
 		 309 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  24.07 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  24.07 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  24.07 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  24.07 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  24.07 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  26.95 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  22.84 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  22.84 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  22.44 
 
 		 393 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>