32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1443 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  75.98 
 
 
179 aa  233  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  45.2 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  41.81 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  44.87 
 
 
175 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  35.46 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  36.43 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  34 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  31.93 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  36.11 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
347 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  27.37 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  28.41 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  25.71 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  26.01 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  27.12 
 
 
343 aa  57.8  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  24.86 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  30.34 
 
 
176 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  24.58 
 
 
177 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  26.82 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  24.58 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  24.07 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  23.63 
 
 
182 aa  44.7  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  24.28 
 
 
357 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  20.44 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>