29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2633 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  358  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  358  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  75.42 
 
 
179 aa  228  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  44.07 
 
 
175 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  40.68 
 
 
176 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  43.59 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  34.75 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  34 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  35 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  30.25 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  36.11 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  26.26 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
347 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  27.27 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  24.57 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  26.55 
 
 
343 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  23.76 
 
 
209 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  30.5 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  23.46 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  26.82 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  23.46 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  22.84 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  25.19 
 
 
357 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>