38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3542 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  68.18 
 
 		 209 aa  266  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  61.58 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  67.88 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  58.76 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  53.67 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  55.9 
 
 		 178 aa  204  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  52.54 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  48.86 
 
 		 347 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  47.46 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  46.07 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  40.68 
 
 		 174 aa  138  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  36.52 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  35.8 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  32.2 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  27.84 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  31.33 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  28.29 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  32.47 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  28.97 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  29.14 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  25.58 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  30.92 
 
 		 309 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  29.22 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  24 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  26.28 
 
 		 393 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  24.14 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  23.24 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  23.24 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>