42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2101 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  57.54 
 
 
179 aa  228  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  53.67 
 
 
177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  52.84 
 
 
347 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  201  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  52.73 
 
 
180 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  50.28 
 
 
177 aa  191  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  50.31 
 
 
178 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  47.19 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  49.38 
 
 
184 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  42.22 
 
 
176 aa  140  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  39.55 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  32.2 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  28.09 
 
 
176 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  34.44 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  90.9  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  27.93 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  32.47 
 
 
165 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  29.33 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  28.33 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  30.68 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  29.8 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  30.92 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  28.39 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  27.52 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  27.81 
 
 
309 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  28.66 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  28.48 
 
 
309 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  27.7 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  27.7 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  27.7 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  27.7 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  27.7 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2633  hypothetical protein  26.35 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0928  hypothetical protein  26.35 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  22.36 
 
 
191 aa  54.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  21.92 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4774  hypothetical protein  25.21 
 
 
393 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  23.81 
 
 
343 aa  48.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  21.47 
 
 
393 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  21.67 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2405  hypothetical protein  25.14 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930343  normal  0.0640752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>