21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04458 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  797    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0682  hypothetical protein  67.94 
 
 
395 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0600  hypothetical protein  68.19 
 
 
395 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  61.83 
 
 
357 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  28.32 
 
 
182 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  30.41 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  29.89 
 
 
176 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  26.74 
 
 
176 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  28.16 
 
 
177 aa  60.1  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  29.93 
 
 
171 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  26.11 
 
 
155 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  24.62 
 
 
223 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  24.18 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  25.53 
 
 
153 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  23.03 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  21.47 
 
 
179 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  23.12 
 
 
191 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  20.59 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  22.6 
 
 
209 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>