33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3707 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  380  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  27.37 
 
 
175 aa  88.2  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  28.74 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  27.84 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  27.33 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  25.44 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  25.86 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  26.28 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  25.41 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  26.45 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  26.58 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  23.6 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  26.37 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  25.16 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0682  hypothetical protein  24.59 
 
 
395 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  22.44 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  25.83 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0600  hypothetical protein  24.59 
 
 
395 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  25.17 
 
 
154 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2405  hypothetical protein  28.22 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930343  normal  0.0640752 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  22.42 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  23.03 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  24.18 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  27.74 
 
 
357 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  24.69 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  24.71 
 
 
393 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  21.64 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  24.43 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  20 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  19.88 
 
 
343 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  26.63 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  22.09 
 
 
303 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>