22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0682 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0600  hypothetical protein  97.97 
 
 
395 aa  794    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0682  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  808    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  67.18 
 
 
393 aa  544  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  60.46 
 
 
357 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  30.54 
 
 
182 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  31.55 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  27.49 
 
 
179 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  27.49 
 
 
176 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  31.91 
 
 
171 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  30.94 
 
 
165 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  28.85 
 
 
177 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  24.38 
 
 
191 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  24.81 
 
 
176 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  24.1 
 
 
223 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  28.68 
 
 
153 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  31.43 
 
 
155 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  22.28 
 
 
209 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  26.67 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  24.16 
 
 
180 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  24.81 
 
 
175 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  22.83 
 
 
179 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>