25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1100 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1100  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  727    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04458  hypothetical protein  61.83 
 
 
393 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0600  hypothetical protein  60.71 
 
 
395 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0682  hypothetical protein  60.46 
 
 
395 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  29.52 
 
 
179 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  30.99 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  25.43 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  29.31 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  30.18 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  29.25 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  27.46 
 
 
223 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5839  hypothetical protein  23.73 
 
 
180 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  32.38 
 
 
179 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  22.26 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  26.09 
 
 
171 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  23.56 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  24.07 
 
 
191 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  26.52 
 
 
175 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  26.53 
 
 
179 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  26.53 
 
 
179 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  26.53 
 
 
179 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  26.53 
 
 
179 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  26.53 
 
 
179 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
153 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>