More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1956 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 283 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  90.46 
 
 		 283 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  53.82 
 
 		 314 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  48.72 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  40.43 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  31.51 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  49.04 
 
 		 160 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  47.06 
 
 		 159 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  45.45 
 
 		 159 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  45.45 
 
 		 159 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  31.8 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  31.45 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  31.45 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  32.98 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  29.7 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  32.29 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.78 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  31.1 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  32.63 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 286 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  32.73 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  30.26 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.92 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  26.86 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.86 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  36.6 
 
 		 154 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  29.08 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  34.64 
 
 		 154 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  27.76 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.74 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  25.79 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  35.06 
 
 		 156 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  24.3 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  24.11 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  25.6 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  24.74 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  38.53 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>