22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2777 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  82.64 
 
 		 242 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  78.21 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  76.28 
 
 		 260 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  74.84 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  69.23 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  71.52 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0410  transcription activator effector binding  43.24 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  39.05 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  31.84 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  39.86 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  37.32 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  35.5 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  35.71 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  35.62 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  34.93 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  25.83 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  27.91 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4616  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.53 
 
 		 153 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.66 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  25.2 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  25.19 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>