45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1237 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  27.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  26.17 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  27.42 
 
 		 156 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  37.18 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  31.71 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  25 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  28 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  26.02 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.32 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  26.4 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  31.82 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  27.2 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  25.2 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  26.98 
 
 		 161 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  40 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.37 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  27.4 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  38.54 
 
 		 160 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  23.58 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  25.6 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  26.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  22.88 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  24.39 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  24.41 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  29.55 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  23.66 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.79 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  25.71 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  25.95 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  21.33 
 
 		 158 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  25.21 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  26.56 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>