55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2214 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 210 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  36.94 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  34.25 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  30.57 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  27.59 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  26.11 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.26 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.27 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  32.82 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  32.38 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  30.28 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  32.71 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  30.91 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  26.14 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  25.97 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  25.66 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  30.71 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  28.46 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.13 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.22 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  29.19 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  37.08 
 
 		 168 aa  51.6  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  24.34 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.83 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  26.5 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6627  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.85 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787104  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  28.48 
 
 		 309 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  28.18 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  27.91 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  26.55 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 270 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.88 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.03 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.39 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  22.79 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  21.62 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  28.86 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  29.06 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.3 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  25.68 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  23.97 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  23.12 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  25.82 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  21.97 
 
 		 343 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  22.81 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 269 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 269 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 273 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  26.5 
 
 		 257 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  33.33 
 
 		 120 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>